Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSKSQ9UJT2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSKSQ9UJT2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSKSQ9UJT2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSKSQ9UJT2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TSKSQ9UJT2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TSKSQ9UJT2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms