Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGEF1Q9UJ41 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABGEF1Q9UJ41 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGEF1Q9UJ41 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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