Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPN4Q9UHM6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms