Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
XCL2Q9UBD3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XCL2Q9UBD3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCL2Q9UBD3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms