Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFIP11Q9UBB9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFIP11Q9UBB9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TFIP11Q9UBB9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms