Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms