Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psma4Q9R1P0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psma4Q9R1P0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms