Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Slit2Q9R1B9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Slit2Q9R1B9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Slit2Q9R1B9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Slit2Q9R1B9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Slit2Q9R1B9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Slit2Q9R1B9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Slit2Q9R1B9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Slit2Q9R1B9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Slit2Q9R1B9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Slit2Q9R1B9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Slit2Q9R1B9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Slit2Q9R1B9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Slit2Q9R1B9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Slit2Q9R1B9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Slit2Q9R1B9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Slit2Q9R1B9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Slit2Q9R1B9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Slit2Q9R1B9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 293.4 ms