Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cml5Q9QXS8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cml5Q9QXS8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cml5Q9QXS8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cml5Q9QXS8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Cml5Q9QXS8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cml5Q9QXS8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Cml5Q9QXS8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Cml5Q9QXS8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cml5Q9QXS8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cml5Q9QXS8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cml5Q9QXS8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cml5Q9QXS8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Cml5Q9QXS8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cml5Q9QXS8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Cml5Q9QXS8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Cml5Q9QXS8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Cml5Q9QXS8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Cml5Q9QXS8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Cml5Q9QXS8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cml5Q9QXS8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Cml5Q9QXS8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Cml5Q9QXS8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Cml5Q9QXS8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cml5Q9QXS8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cml5Q9QXS8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cml5Q9QXS8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cml5Q9QXS8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cml5Q9QXS8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cml5Q9QXS8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cml5Q9QXS8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cml5Q9QXS8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cml5Q9QXS8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cml5Q9QXS8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cml5Q9QXS8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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