Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kifc1Q9QWT9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kifc1Q9QWT9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kifc1Q9QWT9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kifc1Q9QWT9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kifc1Q9QWT9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kifc1Q9QWT9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kifc1Q9QWT9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kifc1Q9QWT9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms