Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PdcQ9QW08 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PdcQ9QW08 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PdcQ9QW08 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms