Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rai2Q9QVY8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rai2Q9QVY8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms