Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00474Q9P2X8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00474Q9P2X8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms