Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCOR3Q9P2K3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCOR3Q9P2K3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCOR3Q9P2K3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCOR3Q9P2K3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCOR3Q9P2K3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms