Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP35Q9P2H5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP35Q9P2H5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
USP35Q9P2H5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms