Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABI3Q9P2A4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABI3Q9P2A4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABI3Q9P2A4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABI3Q9P2A4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABI3Q9P2A4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABI3Q9P2A4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABI3Q9P2A4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ABI3Q9P2A4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABI3Q9P2A4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABI3Q9P2A4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABI3Q9P2A4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABI3Q9P2A4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms