Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR3BQ9P1U1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR3BQ9P1U1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms