Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CABP1Q9NZU7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CABP1Q9NZU7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CABP1Q9NZU7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CABP1Q9NZU7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CABP1Q9NZU7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CABP1Q9NZU7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CABP1Q9NZU7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms