Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CDK12Q9NYV4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.76■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CDK12Q9NYV4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms