Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NKIRAS1Q9NYS0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms