Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
TMOD3Q9NYL9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TMOD3Q9NYL9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TMOD3Q9NYL9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
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