Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA8Q9NY65 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms