Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMPD4Q9NXE4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMPD4Q9NXE4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMPD4Q9NXE4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.3 ms