Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD3Q9NX63 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD3Q9NX63 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHCHD3Q9NX63 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms