Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COMMD8Q9NX08 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COMMD8Q9NX08 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COMMD8Q9NX08 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms