Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 NRDC-211ENST00000491410 1020 ntTSL 219.79■□□□□ 0.764e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.694e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.474e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.14e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.174e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-225ENST00000553064 1786 ntTSL 513.93□□□□□ -0.184e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.226e-11■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 MTCH1-205ENST00000471737 629 ntTSL 213.43□□□□□ -0.264e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 GPR107-207ENST00000493417 2833 ntTSL 1 (best)13.24□□□□□ -0.296e-11■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.384e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.424e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 GPR107-203ENST00000372410 6991 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.596e-11■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 URB2-201ENST00000258243 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.634e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.676e-11■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.726e-11■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-210ENST00000547859 1919 ntTSL 29.92□□□□□ -0.824e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.924e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.014e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 MTCH1-203ENST00000418541 602 ntTSL 38.71□□□□□ -1.024e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-219ENST00000550733 754 ntTSL 28.39□□□□□ -1.074e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 GTSF1-208ENST00000552395 671 ntTSL 57.65□□□□□ -1.184e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-209ENST00000547048 1696 ntTSL 26.55□□□□□ -1.364e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.394e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 GTSF1-204ENST00000546931 902 ntTSL 55.61□□□□□ -1.514e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.654e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 GTSF1-202ENST00000546575 458 ntTSL 24.45□□□□□ -1.74e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 PSMA1-207ENST00000528307 1394 ntTSL 53.74□□□□□ -1.814e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 PSMA1-205ENST00000527632 693 ntTSL 23.71□□□□□ -1.824e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 PSMA1-214ENST00000533331 575 ntTSL 42.85□□□□□ -1.954e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 PSMA1-210ENST00000531023 645 ntTSL 22.29□□□□□ -2.044e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 LRIG2-202ENST00000466069 564 ntTSL 22.28□□□□□ -2.044e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 LRIG2-204ENST00000470000 365 ntTSL 22.15□□□□□ -2.074e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 GPR107-206ENST00000483935 177 ntTSL 51.74□□□□□ -2.132e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 GTSF1-207ENST00000552336 520 ntTSL 31.52□□□□□ -2.174e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 FOXP4-206ENST00000451305 367 ntTSL 1 (best)17.55■□□□□ 0.42e-35■■■■■ 42.1
RBM22Q9NW64 WDR26-207ENST00000480676 1725 ntTSL 511.3□□□□□ -0.67e-8■■■■■ 42.1
RBM22Q9NW64 TFRC-215ENST00000491658 396 ntTSL 51.1□□□□□ -2.232e-44■■■■■ 42.1
RBM22Q9NW64 ZNF800-206ENST00000439506 410 ntTSL 1 (best)2.26□□□□□ -2.051e-7■■■■■ 42.1
RBM22Q9NW64 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.35e-9■■■■■ 42.1
RBM22Q9NW64 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-9■■■■■ 42.1
RBM22Q9NW64 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.75e-9■■■■■ 42.1
RBM22Q9NW64 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.625e-9■■■■■ 42.1
RBM22Q9NW64 FOXP4-201ENST00000307972 3745 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.525e-9■■■■■ 42.1
RBM22Q9NW64 MVD-209ENST00000565149 2352 ntTSL 1 (best)19.14■□□□□ 0.661e-8■■■■■ 42.1
RBM22Q9NW64 HSP90AA1-208ENST00000557234 584 ntTSL 317.92■□□□□ 0.465e-11■■■■■ 42
RBM22Q9NW64 HSP90AA1-206ENST00000556554 552 ntTSL 26.35□□□□□ -1.395e-11■■■■■ 42
RBM22Q9NW64 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.173e-10■■■■■ 41.9
RBM22Q9NW64 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.023e-10■■■■■ 41.9
RBM22Q9NW64 RBM39-207ENST00000412738 1018 ntTSL 313.79□□□□□ -0.21e-8■■■■■ 41.8
RBM22Q9NW64 RBM39-214ENST00000434927 716 ntTSL 59.23□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 41.8
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.141e-24■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-207ENST00000585828 2139 ntTSL 1 (best)15.8■□□□□ 0.121e-24■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.071e-24■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.121e-24■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-209ENST00000586201 881 ntTSL 312.68□□□□□ -0.381e-24■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-217ENST00000588138 573 ntTSL 512.08□□□□□ -0.481e-24■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-205ENST00000544137 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.611e-24■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-202ENST00000343619 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.861e-24■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-201ENST00000264649 4110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.881e-24■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-213ENST00000587510 564 ntTSL 47.11□□□□□ -1.271e-24■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.381e-6■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 ALYREF-204ENST00000512673 441 ntTSL 214.96□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.222e-9■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-9■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.351e-11■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 GLUL-207ENST00000463851 939 ntTSL 310.18□□□□□ -0.782e-9■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 GLUL-212ENST00000491322 6132 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.811e-11■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 TNPO3-203ENST00000471234 3283 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.936e-15■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 TNPO3-205ENST00000627585 4514 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.936e-15■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.056e-15■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.136e-15■■■■■ 41.7
RBM22Q9NW64 TKT-209ENST00000466765 693 ntTSL 217.64■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 41.6
RBM22Q9NW64 TKT-214ENST00000494523 1955 ntTSL 213.27□□□□□ -0.291e-8■■■■■ 41.6
RBM22Q9NW64 TKT-206ENST00000460343 7286 ntTSL 211.91□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 41.6
RBM22Q9NW64 ZNF316-203ENST00000614588 939 ntTSL 321.51■■□□□ 1.031e-8■■■■■ 41.6
RBM22Q9NW64 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 41.6
RBM22Q9NW64 ZNF316-202ENST00000427912 520 ntTSL 314.48□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 41.6
RBM22Q9NW64 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 41.6
RBM22Q9NW64 HNRNPK-206ENST00000457156 1283 ntTSL 517.95■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 41.6
RBM22Q9NW64 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 41.6
RBM22Q9NW64 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 41.6
RBM22Q9NW64 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 41.6
RBM22Q9NW64 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.66e-8■■■■■ 41.6
RBM22Q9NW64 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 41.6
RBM22Q9NW64 UQCRH-203ENST00000486951 687 ntTSL 312.63□□□□□ -0.396e-20■■■■■ 41.5
RBM22Q9NW64 UQCRH-201ENST00000311672 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.526e-20■■■■■ 41.5
RBM22Q9NW64 UQCRH-205ENST00000496387 674 ntTSL 1 (best)5.94□□□□□ -1.466e-20■■■■■ 41.5
RBM22Q9NW64 UQCRH-204ENST00000489056 553 ntTSL 23.95□□□□□ -1.786e-20■■■■■ 41.5
RBM22Q9NW64 RBM6-208ENST00000438912 473 ntTSL 53.91□□□□□ -1.789e-11■■■■■ 41.4
RBM22Q9NW64 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.668e-8■■■■■ 41.3
RBM22Q9NW64 PABPC4-219ENST00000525045 765 ntTSL 213.95□□□□□ -0.181e-12■■■■■ 41.3
RBM22Q9NW64 CTTN-210ENST00000525852 1470 ntTSL 512.45□□□□□ -0.423e-15■■■■■ 41.2
RBM22Q9NW64 HSPA9-211ENST00000512328 482 ntTSL 34.23□□□□□ -1.731e-7■■■■■ 41.2
RBM22Q9NW64 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 32.27□□□□□ -2.051e-7■■■■■ 41.2
RBM22Q9NW64 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.011e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 TSPAN17-205ENST00000504168 884 ntTSL 523.95■■□□□ 1.421e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.121e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.061e-7■■■■■ 41.1
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