Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPL17Q9NRX2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL17Q9NRX2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL17Q9NRX2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms