Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XPNPEP3Q9NQH7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPNPEP3Q9NQH7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPNPEP3Q9NQH7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPNPEP3Q9NQH7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms