Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTN4Q9NQC3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTN4Q9NQC3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN4Q9NQC3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN4Q9NQC3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN4Q9NQC3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN4Q9NQC3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN4Q9NQC3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN4Q9NQC3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN4Q9NQC3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN4Q9NQC3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN4Q9NQC3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN4Q9NQC3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN4Q9NQC3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTN4Q9NQC3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTN4Q9NQC3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms