Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEPEQ9NQ76 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEPEQ9NQ76 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms