Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKKSQ9NPJ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MKKSQ9NPJ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKKSQ9NPJ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKKSQ9NPJ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms