Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SSU72Q9NP77 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSU72Q9NP77 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms