Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vstm2bQ9JME9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm2bQ9JME9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm2bQ9JME9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm2bQ9JME9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm2bQ9JME9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm2bQ9JME9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm2bQ9JME9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm2bQ9JME9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm2bQ9JME9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm2bQ9JME9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm2bQ9JME9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm2bQ9JME9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vstm2bQ9JME9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm2bQ9JME9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms