Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PnkpQ9JLV6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms