Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmgn5Q9JL35 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgn5Q9JL35 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hmgn5Q9JL35 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmgn5Q9JL35 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
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