Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Extl1Q9JKV7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Extl1Q9JKV7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Extl1Q9JKV7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Extl1Q9JKV7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Extl1Q9JKV7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Extl1Q9JKV7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Extl1Q9JKV7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms