Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJH7

Trpm5, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm5Q9JJH7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm5Q9JJH7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm5Q9JJH7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm5Q9JJH7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm5Q9JJH7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trpm5Q9JJH7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm5Q9JJH7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm5Q9JJH7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms