Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EPB41L4AQ9HCS5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EPB41L4AQ9HCS5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms