Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC21

SLC25A19, Mitochondrial thiamine pyrophosphate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A19Q9HC21 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A19Q9HC21 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A19Q9HC21 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A19Q9HC21 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms