Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC10

OTOF, Otoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOFQ9HC10 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
OTOFQ9HC10 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
OTOFQ9HC10 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
OTOFQ9HC10 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
OTOFQ9HC10 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
OTOFQ9HC10 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
OTOFQ9HC10 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
OTOFQ9HC10 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
OTOFQ9HC10 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
OTOFQ9HC10 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
OTOFQ9HC10 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOFQ9HC10 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOFQ9HC10 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
OTOFQ9HC10 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms