Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI0

PARVG, Gamma-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVGQ9HBI0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARVGQ9HBI0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARVGQ9HBI0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARVGQ9HBI0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARVGQ9HBI0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARVGQ9HBI0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARVGQ9HBI0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARVGQ9HBI0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PARVGQ9HBI0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PARVGQ9HBI0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARVGQ9HBI0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARVGQ9HBI0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARVGQ9HBI0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms