Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUDS3Q9H7L9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SUDS3Q9H7L9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms