Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSS3Q9H6R3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSS3Q9H6R3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSS3Q9H6R3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms