Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STN1Q9H668 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STN1Q9H668 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms