Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TAF1DQ9H5J8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TAF1DQ9H5J8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TAF1DQ9H5J8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TAF1DQ9H5J8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms