Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NXF3Q9H4D5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NXF3Q9H4D5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms