Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3N1

TMX1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1Q9H3N1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMX1Q9H3N1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMX1Q9H3N1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX1Q9H3N1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMX1Q9H3N1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMX1Q9H3N1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMX1Q9H3N1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMX1Q9H3N1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.2 ms