Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1EQ9GZS1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1EQ9GZS1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms