Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Brd4Q9ESU6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Brd4Q9ESU6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Brd4Q9ESU6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Brd4Q9ESU6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Brd4Q9ESU6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Brd4Q9ESU6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Brd4Q9ESU6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
Brd4Q9ESU6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Brd4Q9ESU6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Brd4Q9ESU6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Brd4Q9ESU6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Brd4Q9ESU6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Brd4Q9ESU6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Brd4Q9ESU6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Brd4Q9ESU6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Brd4Q9ESU6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Brd4Q9ESU6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Brd4Q9ESU6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Brd4Q9ESU6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Brd4Q9ESU6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Brd4Q9ESU6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Brd4Q9ESU6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Brd4Q9ESU6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Brd4Q9ESU6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Brd4Q9ESU6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms