Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ush1cQ9ES64 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ush1cQ9ES64 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ush1cQ9ES64 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ush1cQ9ES64 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms